莱拉打开了新的世界，却发现每一个世界都在被同一个“教会”统治。
第二季紧接第一季。莱拉和威尔通过裂隙来到一个被“尘埃”侵蚀的濒死城市齐加齐亚。在这里，莱拉继续阅读“黄金罗盘”，发现预言所说的“第二个亚当”正是威尔。与此同时，教会派出的刺客已追踪到他们。在齐加齐亚，莱拉遇到了一个没有精灵的科学家玛丽，她正在研究“尘埃”的暗物质属性。威尔则试图找到回到自己世界的方法，去拯救他被谋害的父亲。本季核心是“选择”：莱拉必须选择是否接受她作为“夏娃”的命运；威尔必须选择拯救父亲还是保护莱拉。季终，莱拉为了救威尔，主动落入教会之手，而威尔穿越回牛津，发现两个世界的时间流速不同，他的世界已经过去了20年。
制作水准维持电影级，平行世界的视觉奇观令人惊叹。相比第一季，哲学思辨更深，对“自由意志”与“原罪”的探讨毫不避讳。两个小主演的演技成熟了很多，那种相依为命的羁绊感太动人了。
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