尼奥拖着失明的双眼走向机器城市，他最后的赌注不是人类的胜利，而是与宿敌的“停战”。
锡安面临最后的围剿，无数哨兵机器钻穿地层，人类最后的堡垒危在旦夕。崔妮蒂在坠毁的飞船中牺牲，尼奥则在与史密斯探员的终极对决中意识到，自己不仅是人类的救世主，也是系统为了删除异常程序史密斯而创造的病毒。他拖着双眼被烧瞎的躯体，在崔妮蒂的引领下走向机器城市。谈判桌上，尼奥向机器的控制程序提出交易：他进入矩阵消灭史密斯，作为交换，机器停止攻击锡安。在暴雨倾盆的最终决斗场，尼奥放任史密斯同化自己，代码崩溃的瞬间，矩阵重启，万物归于平衡。
沃卓斯基姐妹为这个伟大的科幻三部曲画上了悲壮而圆满的句号。动作场面登峰造极，哲学思辨深沉如海，最后尼奥的牺牲赋予了“救世主”全新的定义。
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